从 [[梅毒之旅]] 归来后，杜刚跑去巴黎，买下《巴黎杂志》部分股权，催福楼拜和布耶为自己写稿。福楼拜正当鄙视积极活跃的杜刚。但后者不忘友谊，在杂志上刊载了布耶有关罗马的三千行长诗，福楼拜很高兴。所以《包法利》完稿后，他同意杜刚的请求，把小说托付给他们。

杜刚又把书转交洛朗，《巴黎杂志》的另一位主编。1856 年 7 月 14 日，他又写信说：“我……向他热烈推荐这部书，因此我们根本不是串通一气，以相同的口吻来招你厌烦。他对你提出的建议没错，而且你只能照此建议行事。请让我们负责你的小说，以使它得以在杂志上发表；我们将对它做一些我们认为必不可少的删节，此后你可照你希望的那样出版单行本，这就是你的事了。”

《巴黎杂志》始创于 1829 年。巴尔扎克也曾与杂志签约，每月为它写四十页，出版商总是不断抱怨他迟交稿、在校对阶段过量修改。现在杜刚与洛朗成了《包法利》的编辑，要对福楼拜行过量修改之事。

凭编辑身份，他们要求福楼拜把小说交给自己做主。两人告诫福楼拜，“你如果不相信我们的才分，至少也该相信我们在这上面的经验和我们对于你的爱好”，认为书中不可不删减的、文笔不够引起兴趣的，就由他们决断删去。

福楼拜回复说：荒谬绝伦。他不情愿，但还是照做了一些删减，结果没有完全满足编辑的要求。小说的出版延期，10 月 1 日起，才开始分六部分在杂志连载。

这个版本是福楼拜妥协后的产物。他同意了个别删改，作为交换，获准插入一些注释。比如 12 月 15 日那一期，人们可以读到福楼拜的解释：“一些我未曾估计到的考虑促使《巴黎杂志》在 12 月 1 日那一期中做了删节。在新一期里他们又有了新的顾虑，认为还需再删去几段。鉴于此，我拒绝对下文承担责任，由此也请读者只看一些片段而不是全文。”这一段被要求删去的，正是艾玛与罗多夫的马车通奸情节。

12 月 3 1 日，福楼拜写信说，自己的小说被指控败坏风俗和宗教：“我已见过预审官，而且很有可能将被处以轻罪处罚……我只不过是个借口，他们是想摧毁《巴黎杂志》，就抓住我进行敲打。” 1 月 16 日又写信给阿希尔：“尽管如此，《包法利》延续着它的成功。它成了黄色书籍，所有人或已读过，正在读或是想读它。”他并不指望“任何公正”，但也为获得同情和更多读者而感到高兴。

面对控告的危险，他请求阿希尔斡旋，让省长给内政大臣写信。他希望能让内政大臣知道，福楼拜在鲁昂是个大家族，在法国也有着深厚的根源。起诉他，尤其是指控他不道德，将会伤害很多人。他还指望上了已故父亲的名望，当局对此不可能无动于衷。

结果无济于事。福楼拜、洛朗，还有《巴黎杂志》的印刷商皮耶，三个人一起被移交到轻罪法庭。传讯预定在 1857 年 1 月 24 日，公诉人为 [[阳具诗人皮那]]。